Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PTPN7P35236 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms