Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DSG3P32926 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DSG3P32926 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSG3P32926 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 ETFRF1-207ENST00000556351 838 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSG3P32926 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSG3P32926 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG3P32926 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG3P32926 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG3P32926 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSG3P32926 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms