Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPS1P31327 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPS1P31327 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CPS1P31327 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CPS1P31327 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CPS1P31327 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPS1P31327 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPS1P31327 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CPS1P31327 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPS1P31327 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CPS1P31327 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPS1P31327 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CPS1P31327 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CPS1P31327 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CPS1P31327 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CPS1P31327 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CPS1P31327 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CPS1P31327 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPS1P31327 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPS1P31327 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPS1P31327 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CPS1P31327 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPS1P31327 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CPS1P31327 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CPS1P31327 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms