Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HOXA10P31260 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms