Protein–RNA interactions for Protein: P27815

PDE4A, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, humanhuman

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Length 886 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4AP27815 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE4AP27815 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE4AP27815 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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