Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGB2P26583 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGB2P26583 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms