Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
POLR2AP24928 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
POLR2AP24928 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms