Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP2A2P16615 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP2A2P16615 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms