Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ITGA4P13612 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms