Protein–RNA interactions for Protein: P10720

PF4V1, Platelet factor 4 variant, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PF4V1P10720 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PF4V1P10720 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms