Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PARP1P09874 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PARP1P09874 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PARP1P09874 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PARP1P09874 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PARP1P09874 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP1P09874 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP1P09874 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP1P09874 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP1P09874 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP1P09874 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP1P09874 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms