Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MMP10P09238 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MMP10P09238 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MMP10P09238 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP10P09238 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms