Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
POLR3DP05423 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
POLR3DP05423 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms