Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ITGB2P05107 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ITGB2P05107 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms