Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC1P02654 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC1P02654 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC1P02654 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC1P02654 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC1P02654 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
APOC1P02654 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC1P02654 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms