Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
APOA1P02647 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA1P02647 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA1P02647 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA1P02647 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA1P02647 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA1P02647 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA1P02647 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA1P02647 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
APOA1P02647 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
APOA1P02647 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms