Protein–RNA interactions for Protein: P02458

COL2A1, Collagen alpha-1(II) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL2A1P02458 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL2A1P02458 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL2A1P02458 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms