Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FOSP01100 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FOSP01100 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
FOSP01100 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FOSP01100 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOSP01100 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOSP01100 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOSP01100 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOSP01100 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOSP01100 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOSP01100 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
FOSP01100 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSP01100 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSP01100 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSP01100 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSP01100 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSP01100 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSP01100 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FOSP01100 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms