Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EGFRP00533 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EGFRP00533 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
EGFRP00533 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EGFRP00533 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EGFRP00533 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EGFRP00533 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EGFRP00533 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EGFRP00533 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EGFRP00533 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EGFRP00533 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms