Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MBD3O95983 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MBD3O95983 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3O95983 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3O95983 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3O95983 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3O95983 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3O95983 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3O95983 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3O95983 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3O95983 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MBD3O95983 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MBD3O95983 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MBD3O95983 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms