Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
POLR1AO95602 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
POLR1AO95602 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms