Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPS6KA4O75676 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPS6KA4O75676 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms