Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMDSO60547 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
GMDSO60547 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMDSO60547 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMDSO60547 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMDSO60547 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMDSO60547 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
GMDSO60547 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
GMDSO60547 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GMDSO60547 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GMDSO60547 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GMDSO60547 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GMDSO60547 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GMDSO60547 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GMDSO60547 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GMDSO60547 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GMDSO60547 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms