Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PLXNC1O60486 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLXNC1O60486 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms