Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PDE6DO43924 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PDE6DO43924 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PDE6DO43924 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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PDE6DO43924 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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