Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
LANCL1O43813 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LANCL1O43813 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms