Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1AO15047 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1AO15047 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1AO15047 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1AO15047 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SETD1AO15047 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SETD1AO15047 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SETD1AO15047 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms