Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ARHGEF10O15013 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARHGEF10O15013 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms