Protein–RNA interactions for Protein: J3QLI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLI3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QLI3 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QLI3 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QLI3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QLI3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QLI3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QLI3 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QLI3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
J3QLI3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
J3QLI3 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
J3QLI3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
J3QLI3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms