Protein–RNA interactions for Protein: A8MUK1

USP17L5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L5A8MUK1 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
USP17L5A8MUK1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms