Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC169A6NNP5 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC169A6NNP5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms