Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA2

SRRM3, Serine/arginine repetitive matrix protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM3A6NNA2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM3A6NNA2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM3A6NNA2 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM3A6NNA2 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM3A6NNA2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM3A6NNA2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM3A6NNA2 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SRRM3A6NNA2 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRRM3A6NNA2 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRRM3A6NNA2 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SRRM3A6NNA2 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SRRM3A6NNA2 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms