Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC85CA6NKD9 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC85CA6NKD9 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms