Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
E2F8A0AVK6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms