Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
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CCDC96Q2M329 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC96Q2M329 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC96Q2M329 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC96Q2M329 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CCDC96Q2M329 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CCDC96Q2M329 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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CCDC96Q2M329 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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CCDC96Q2M329 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC96Q2M329 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC96Q2M329 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC96Q2M329 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC96Q2M329 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC96Q2M329 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
CCDC96Q2M329 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CCDC96Q2M329 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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