Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ECM1Q16610 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 TIMM21-201ENST00000169551 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 DCP1A-206ENST00000610213 5994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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ECM1Q16610 AF131216.1-201ENST00000498997 5856 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 RNA5SP232-201ENST00000364144 119 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
ECM1Q16610 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
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