Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RPS4Y1-201ENST00000250784 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 LINC00189-203ENST00000447125 783 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 CCL7-202ENST00000394627 696 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC123768.1-201ENST00000486285 432 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC6.26□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
PTCH1Q13635 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
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