Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC116553.2-201ENST00000564203 463 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC073136.2-201ENST00000417282 849 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AL606490.1-201ENST00000452266 765 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 E2F5-204ENST00000517476 1094 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 RPL27-207ENST00000590864 569 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CUL3Q13618 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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