Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 MRPL57P3-201ENST00000619218 176 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 FARP1-219ENST00000596580 13532 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 MTTP-208ENST00000511045 3154 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 MAP4-210ENST00000439356 2743 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 FOPNL-206ENST00000573968 2039 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 GABPB2-202ENST00000368918 8964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 SCYL3-202ENST00000367771 6364 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 ZNF182-201ENST00000376943 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 OR14J1-203ENST00000641895 6443 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 ANK2-203ENST00000394537 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
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FOXC1Q12948 VLDLR-AS1-201ENST00000416826 3167 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 MUSK-205ENST00000374448 2754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 ZSCAN32-201ENST00000304926 3027 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 TMEM106A-208ENST00000612339 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
FOXC1Q12948 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
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