Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 OR8H1-202ENST00000610894 927 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 Z98755.1-201ENST00000407015 1384 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LBX1-AS1-202ENST00000434878 418 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LINC01192-206ENST00000489012 818 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 UBE2D3-217ENST00000504211 578 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC097534.1-201ENST00000507803 521 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTPRCP08575 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTPRCP08575 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTPRCP08575 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PTPRCP08575 ZNF540-204ENST00000586792 564 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 BAALC-AS1-201ENST00000499522 1353 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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