Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC104417.1-201ENST00000523974 751 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC005377.1-201ENST00000605126 456 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF215-205ENST00000529903 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PAGE2-202ENST00000374968 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC090018.1-201ENST00000434369 367 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC02170-201ENST00000561519 555 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
SH3BP4Q9P0V3 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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