Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 FOXP2-209ENST00000393498 2617 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 ATP5A1P7-201ENST00000453978 1279 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 OR11I1P-201ENST00000486033 954 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
MIS18AQ9NYP9 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 OR5AQ1P-203ENST00000641818 1529 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 TAB3-AS2-201ENST00000445240 292 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
MIS18AQ9NYP9 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
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