Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF600-201ENST00000338230 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 NDUFS1-201ENST00000233190 11819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 GBP3-202ENST00000370481 3067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 KIF18A-201ENST00000263181 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC009237.3-203ENST00000442128 3551 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MIR1204-201ENST00000408388 67 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CAPN3-210ENST00000561817 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MCCC1-210ENST00000492597 2774 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 THOC2-220ENST00000618150 3211 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF559-212ENST00000592896 1488 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CLNK-204ENST00000515667 4180 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms