Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 SNHG14-220ENST00000553149 513 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GEMIN8P2-201ENST00000569855 700 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006435.2-202ENST00000573007 442 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC104581.3-201ENST00000573621 348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL160291.1-201ENST00000574842 1002 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CIRBP-AS1-201ENST00000585832 994 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BLVRB-202ENST00000595483 649 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF548-209ENST00000598895 571 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SYDE1-203ENST00000600252 3832 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DUSP22-211ENST00000604971 3824 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL080285.2-201ENST00000612765 458 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KRTAP4-9-202ENST00000617453 558 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC02348-201ENST00000618724 489 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC006453.3-201ENST00000635891 377 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM225A-202ENST00000453010 5625 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TXLNA-202ENST00000373610 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LEPR-203ENST00000371058 2805 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 C4orf33-201ENST00000281146 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF3-203ENST00000369486 7254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TYRP1-203ENST00000388918 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SSBP3-AS1-201ENST00000361350 2624 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP1R26P5-201ENST00000416640 3664 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 IMMT-206ENST00000442664 2627 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TTLL5-207ENST00000554510 2624 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKA-201ENST00000331886 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF571-206ENST00000593133 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNGAP1-207ENST00000628646 4264 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DTX1-201ENST00000257600 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TTYH2-201ENST00000269346 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 EXT2-203ENST00000395673 3454 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC13A3-211ENST00000495082 1887 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PIK3AP1-201ENST00000339364 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 GRIK1-206ENST00000399913 3234 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ELMOD3-203ENST00000409013 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF9-205ENST00000437457 3758 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 SPIB-205ENST00000595883 3791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AGPAT3-203ENST00000398058 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KRT36-201ENST00000328119 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 AXIN2-209ENST00000618960 4060 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK10-262ENST00000641051 5738 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 FPGT-202ENST00000370898 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PDP1-202ENST00000396200 4358 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 HMGB3-201ENST00000325307 3560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 KLK2-201ENST00000325321 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ENTPD7-201ENST00000370489 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 DLG5-201ENST00000372391 7415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 BTNL2-201ENST00000374993 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LINGO2-202ENST00000379992 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 MPP4-205ENST00000409474 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 PARP1P1-201ENST00000413631 3026 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBA1A-207ENST00000550767 1384 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms