Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 AL590004.4-201ENST00000566733 7060 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 RNF14-202ENST00000356143 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 SLIT2-203ENST00000503837 4752 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 HMGCR-201ENST00000287936 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 LINC00930-202ENST00000557075 1541 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 SMARCA1-202ENST00000371122 4099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 MAP7D3-203ENST00000370661 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 MORF4L2-203ENST00000422154 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 AKAP4-202ENST00000376064 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 CLDN2-203ENST00000541806 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 RSU1-205ENST00000602389 3639 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 ZC3H7A-201ENST00000355758 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 RNA5SP145-201ENST00000363124 125 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 SLIT1-AS1-201ENST00000424428 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 PRKAG2-AS1-201ENST00000464464 382 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL654P-201ENST00000479178 292 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL745P-201ENST00000484900 299 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 MSRA-210ENST00000528246 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC243960.5-201ENST00000597858 255 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 Z97200.1-201ENST00000606154 2045 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC005005.3-201ENST00000609017 1410 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 TRY2P-202ENST00000616556 2039 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 PLCB1-202ENST00000378637 3864 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 CACNB4-239ENST00000636947 5575 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC009148.1-201ENST00000570148 2693 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 PAPPA2-201ENST00000367661 4369 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 AL049833.3-201ENST00000623920 3738 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 LIMCH1-218ENST00000513024 5129 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 LINC02239-201ENST00000504339 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 LINC01761-201ENST00000424943 2755 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 DCLRE1C-204ENST00000378246 2637 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 COX6C-201ENST00000297564 433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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CNKSR2Q8WXI2 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 TRBV10-2-201ENST00000426318 395 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 RAB28P5-201ENST00000427490 651 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 PIGCP2-201ENST00000433617 835 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 TMEM127-203ENST00000435268 582 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 COX6C-203ENST00000518171 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 AC241377.2-201ENST00000612313 553 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 RN7SL575P-201ENST00000620774 299 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 ZNF736-201ENST00000355095 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 AGXT2-206ENST00000618015 2181 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
CNKSR2Q8WXI2 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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