Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
COL24A1Q17RW2 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC090286.3-201ENST00000573133 187 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 BNIP3P19-201ENST00000605397 577 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC110760.1-201ENST00000513770 590 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AP000462.1-201ENST00000535704 818 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 CLYBL-AS2-201ENST00000430125 695 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AL137918.1-201ENST00000624542 1922 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL24A1Q17RW2 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms