Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ARAFP1-201ENST00000422172 605 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC015660.3-201ENST00000559569 198 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 NNT-201ENST00000264663 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 SCN8A-201ENST00000354534 11556 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 GLRA2-201ENST00000218075 3216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 FSTL5-201ENST00000306100 4831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 FREM1-204ENST00000422223 10086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 WNT2B-203ENST00000369686 10879 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LAMA3Q16787 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC027455.1-201ENST00000574104 594 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 PREPL-207ENST00000409957 4703 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 CR1-206ENST00000400960 6959 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SSPO-201ENST00000378016 15589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SOX6-202ENST00000396356 8865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ADAD1P2-201ENST00000588476 646 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
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LAMA3Q16787 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MAVS-201ENST00000416600 11596 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 CD109-202ENST00000422508 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MTND2P40-201ENST00000436718 841 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 ZNF43-205ENST00000594012 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
LAMA3Q16787 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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