Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 PTPN12-206ENST00000435495 2526 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RABGAP1L-216ENST00000486220 772 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC069113.2-201ENST00000517735 359 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 LINC02303-204ENST00000555442 889 ntTSL 3 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC010649.1-203ENST00000592230 454 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 WWOX-217ENST00000620008 450 ntTSL 2 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC3.92□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC053481.2-202ENST00000582394 1500 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC135895.1-201ENST00000360528 1058 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SDCBP-203ENST00000424270 1277 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 HMGN1P2-201ENST00000445197 310 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 HIGD1AP8-201ENST00000453927 274 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AL355852.1-201ENST00000454081 1771 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
SMCO1Q147U7 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
SMCO1Q147U7 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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