Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 LINC02307-201ENST00000553827 257 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AP000641.1-201ENST00000531988 1639 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL357172.1-201ENST00000556016 593 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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PTCH1Q13635 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PTCH1Q13635 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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PTCH1Q13635 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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PTCH1Q13635 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 MEG8-217ENST00000556637 924 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
PTCH1Q13635 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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