Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 VRK2-203ENST00000417641 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NPIPB13-201ENST00000520915 3584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 HLF-210ENST00000575345 3589 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TMEM108-201ENST00000321871 3744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL450423.1-201ENST00000615176 1857 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 IQGAP1-201ENST00000268182 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CACNA1D-224ENST00000637424 6856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC090643.1-201ENST00000623600 3100 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ADAM3A-205ENST00000481351 2379 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 IRF6-201ENST00000367021 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 GJC1-202ENST00000426548 7640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ADGRL3-209ENST00000508693 5009 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SLC25A30-204ENST00000519676 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZC3H11A-203ENST00000367212 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NAV2-202ENST00000360655 10667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC006581.1-201ENST00000545706 496 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SRSF5-209ENST00000555349 565 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TMTC2-204ENST00000549919 6211 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 HSP90AB7P-201ENST00000450068 2454 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC145138.1-201ENST00000512908 2851 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LINC00559-201ENST00000569476 3867 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC012213.2-201ENST00000562917 4597 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 RPGRIP1L-202ENST00000379925 5297 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 GPR1-AS-201ENST00000623040 3708 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SIRPB1-205ENST00000381605 3241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LAMA2-205ENST00000617695 9678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LAMA2-206ENST00000618192 9687 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 LRRC28-201ENST00000301981 5971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 TCF12-206ENST00000543579 1809 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 OR2T6-202ENST00000641644 4670 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ADAL-202ENST00000422466 3767 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 GLRA3-201ENST00000274093 8770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC009948.5-201ENST00000624360 4406 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 NAT10-201ENST00000257829 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 AC104581.5-201ENST00000624171 7141 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 FLJ42393-201ENST00000623801 2270 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 DCHS2-207ENST00000623607 8912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CLN3Q13286 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
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